Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms