Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ctdsp2Q8BX07 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdsp2Q8BX07 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdsp2Q8BX07 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdsp2Q8BX07 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp2Q8BX07 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdsp2Q8BX07 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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