Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtpaQ8BWP5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms