Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc9a4Q8BUE1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc9a4Q8BUE1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc9a4Q8BUE1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc9a4Q8BUE1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc9a4Q8BUE1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a4Q8BUE1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms