Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BPC6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BPC6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BPC6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms