Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms