Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp54Q8BL06 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp54Q8BL06 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms