Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zcchc4Q8BKW4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms