Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnrc6bQ8BKI2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms