Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rspo4Q8BJ73 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms