Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup107Q8BH74 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms