Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg4dQ8BGV9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg4dQ8BGV9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg4dQ8BGV9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg4dQ8BGV9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atg4dQ8BGV9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atg4dQ8BGV9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4dQ8BGV9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms