Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms