Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ubash3bQ8BGG7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ubash3bQ8BGG7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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