Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms