Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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