Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmtc4Q8BG19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmtc4Q8BG19 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms