Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.2Q85ZW9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.2Q85ZW9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.2Q85ZW9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.2Q85ZW9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.2Q85ZW9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms