Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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H2-M10.4Q85ZW8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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