Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Smim19Q80ZU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim19Q80ZU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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