Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ttc28Q80XJ3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ttc28Q80XJ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ttc28Q80XJ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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