Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Zbed4Q80WQ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed4Q80WQ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Zbed4Q80WQ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Zbed4Q80WQ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms