Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sestd1Q80UK0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms