Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rims3Q80U57 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms