Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NischQ80TM9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NischQ80TM9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NischQ80TM9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NischQ80TM9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NischQ80TM9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NischQ80TM9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
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