Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Clec18aQ7TSQ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Clec18aQ7TSQ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Clec18aQ7TSQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Clec18aQ7TSQ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Clec18aQ7TSQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Clec18aQ7TSQ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms