Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClmQ7TSN2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClmQ7TSN2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms