Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnf1Q7TSH7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnf1Q7TSH7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnf1Q7TSH7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnf1Q7TSH7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnf1Q7TSH7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnf1Q7TSH7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnf1Q7TSH7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms