Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms