Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1cQ7TSF0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms