Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actn1Q7TPR4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms