Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms