Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms