Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HhipQ7TN16 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HhipQ7TN16 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms