Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg4Q7TMD7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms