Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms