Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ubfd1Q78JW9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubfd1Q78JW9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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