Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps27Q6ZWU9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms