Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncapd3Q6ZQK0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms