Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms