Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80Q6ZPV2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms