Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms