Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms