Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timd4Q6U7R4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms