Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc4Q6S5L9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc4Q6S5L9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms