Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx4Q6RUU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms