Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt9Q6RHW0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms