Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms