Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms