Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1cQ6PDZ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms